Как установить R на Debian/Ubuntu

Это руководство объясняет, как установить язык программирования R на ваш сервер Debian или Ubuntu. R — это язык с открытым исходным кодом, широко используемый для разработки статистического программного обеспечения, анализа данных и визуализации.

Заказать сервер

Для работы с R и анализа данных HostMyServers предлагает несколько вариантов:

VPS Performance — Идеально для интенсивных вычислений
VPS NVMe — Отличное соотношение цены и качества
Выделенные серверы Eco — Для больших наборов данных
Выделенные серверы Performance — Максимальная производительность для машинного обучения

Требования

SSH-доступ root или пользователь с sudo
Debian 11/12 или Ubuntu 20.04/22.04/24.04
Минимум 1 ГБ RAM (рекомендуется 2 ГБ+ для тяжёлых вычислений)

Почему использовать R?

R особенно подходит для:

Статистический анализ: Тесты, регрессионные модели, дисперсионный анализ
Визуализация данных: Графики готовые к публикации с ggplot2
Машинное обучение: Классификация, кластеризация, нейронные сети
Биоинформатика: Геномный и протеомный анализ
Финансы: Анализ рисков, финансовое моделирование

Шаг 1: Установка зависимостей

Поскольку R активно развивается, последняя стабильная версия не всегда доступна в репозиториях Debian/Ubuntu. Мы добавим внешний репозиторий, поддерживаемый CRAN.

Обновление системы

sudo apt update && sudo apt upgrade -y

Установка необходимых инструментов

sudo apt install -y dirmngr gnupg apt-transport-https ca-certificates software-properties-common

Эти пакеты обеспечивают:

dirmngr: Управление сертификатами и сетевые операции
gnupg: Управление GPG-ключами
apt-transport-https: Поддержка HTTPS для APT
ca-certificates: Сертификаты центров сертификации
software-properties-common: Управление репозиториями

Шаг 2: Добавление репозитория CRAN

Добавить GPG-ключ

sudo gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key '95C0FAF38DB3CCAD0C080A7BDC78B2DDEABC47B7'
sudo gpg --armor --export '95C0FAF38DB3CCAD0C080A7BDC78B2DDEABC47B7' | sudo tee /etc/apt/trusted.gpg.d/cran_debian_key.asc

Добавить репозиторий для вашего дистрибутива

Для Debian 11 (Bullseye)

echo "deb http://cloud.r-project.org/bin/linux/debian bullseye-cran40/" | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/r-project.list

Для Debian 12 (Bookworm)

echo "deb http://cloud.r-project.org/bin/linux/debian bookworm-cran40/" | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/r-project.list

Для Ubuntu 22.04 (Jammy)

sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu jammy-cran40/"

Для Ubuntu 24.04 (Noble)

sudo add-apt-repository "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu noble-cran40/"

Обновить список пакетов

sudo apt update

Шаг 3: Установка R

Проверить доступную версию

apt-cache policy r-base

Установить R

sudo apt install -y r-base r-base-dev

Пакет r-base-dev включает инструменты разработки, необходимые для компиляции пакетов R из исходников.

Проверить установку

R --version

Вы должны увидеть что-то вроде:

R version 4.4.x (2024-xx-xx) -- "Pile of Leaves"
Copyright (C) 2024 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu

Шаг 4: Использование R

Запуск R в интерактивном режиме

Для личного использования:

Для установки пакетов, доступных всем пользователям:

sudo -i R

Интерфейс R

В R вы увидите приглашение >. Вот несколько базовых команд:

# Показать версию
version

# Получить справку
help()

# Выйти из R
q()

Шаг 5: Установка пакетов из CRAN

R имеет тысячи пакетов, доступных на CRAN (Comprehensive R Archive Network).

Установить пакет

В интерпретаторе R:

install.packages('имя_пакета')

Пример: Установка популярных пакетов

# Манипуляция данными
install.packages('dplyr')
install.packages('tidyr')
install.packages('data.table')

# Визуализация
install.packages('ggplot2')

# Машинное обучение
install.packages('caret')
install.packages('randomForest')

# Отчёты
install.packages('rmarkdown')
install.packages('knitr')

Загрузить пакет

library(ggplot2)

Практический пример с txtplot

Установим простой пакет для создания ASCII-графиков:

# Установить пакет
install.packages('txtplot')

# Загрузить пакет
library('txtplot')

# Создать простой график
txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = 'speed', ylab = 'distance')

Результат:

    +----+--------+--------+-------+--------+--+
120 +                                     *    +
    |                                          |
d 100 +                                   *     +
i   |                            *         *   |
s 80 +                           *    *        +
t   |                        *  * *            |
a 60 +                        *                +
n   |                  *  * *                  |
c 40 +            *    **                      +
e   |         * *  *  *                        |
 20 +    * *  *                                +
    +----+--------+--------+-------+--------+--+
         5       10       15      20       25
                       speed

Шаг 6: Установка RStudio Server (опционально)

RStudio Server предоставляет веб-интерфейс для R.

Скачать и установить RStudio Server

Для Debian/Ubuntu:

# Установить зависимости
sudo apt install -y gdebi-core

# Скачать RStudio Server (проверьте последнюю версию на https://posit.co/download/rstudio-server/)
wget https://download2.rstudio.org/server/jammy/amd64/rstudio-server-2024.04.2-764-amd64.deb

# Установить
sudo gdebi rstudio-server-2024.04.2-764-amd64.deb

Проверить статус

sudo systemctl status rstudio-server

Настроить файрвол

sudo ufw allow 8787/tcp
sudo ufw reload

Доступ к RStudio Server

Откройте браузер и перейдите по адресу:

http://IP_СЕРВЕРА:8787

Войдите с вашими учётными данными Linux.

Расширенная настройка

Установить зеркало CRAN по умолчанию

Создайте или отредактируйте файл .Rprofile:

nano ~/.Rprofile

Добавьте:

options(repos = c(CRAN = "https://cloud.r-project.org"))

Установка системных пакетов для R

Некоторые пакеты R требуют системных библиотек:

# Для пакетов с общими зависимостями
sudo apt install -y libcurl4-openssl-dev libssl-dev libxml2-dev libfontconfig1-dev libharfbuzz-dev libfribidi-dev libfreetype6-dev libpng-dev libtiff5-dev libjpeg-dev

Увеличение доступной памяти

Для тяжёлых вычислений можно увеличить лимит памяти в R:

# Проверить доступную память
memory.limit()

# На Linux лимит обычно равен доступной RAM

R-скрипты из командной строки

Запуск R-скрипта

Rscript my_script.R

Пример скрипта

Создайте файл analysis.R:

#!/usr/bin/env Rscript

# Загрузить данные
data <- read.csv("data.csv")

# Описательная статистика
summary(data)

# Сохранить результаты
write.csv(summary(data), "results.csv")

print("Анализ завершён!")

Запустите его:

Rscript analysis.R

Пакет	Описание
`tidyverse`	Коллекция пакетов для data science
`dplyr`	Манипуляция данными
`ggplot2`	Визуализация
`readr`	Импорт данных
`tidyr`	Очистка данных

Пакет	Описание
`caret`	Унифицированный ML-фреймворк
`randomForest`	Случайные леса
`xgboost`	Градиентный бустинг
`keras`	Глубокое обучение
`mlr3`	Современный ML-фреймворк

Пакет	Описание
`stats`	Базовая статистика (встроен)
`lme4`	Смешанные модели
`survival`	Анализ выживаемости
`forecast`	Временные ряды

Устранение неполадок

Ошибка при установке пакета

Если возникают ошибки компиляции:

# Установить инструменты разработки
sudo apt install -y build-essential

# Установить общие зависимости
sudo apt install -y libcurl4-openssl-dev libssl-dev libxml2-dev

Пакет не найден

Проверьте правильность имени пакета на CRAN.

Недостаточно памяти

Если R исчерпывает память:

# Очистить окружение
rm(list = ls())

# Принудительная сборка мусора
gc()

Проверка установленных пакетов

# Список всех пакетов
installed.packages()

# Проверить, установлен ли пакет
"ggplot2" %in% rownames(installed.packages())

Обновление R

Для обновления R до последней версии:

sudo apt update
sudo apt upgrade r-base r-base-dev

Внимание

После крупного обновления R может потребоваться переустановка пакетов.

Заказать сервер​

Требования​

Почему использовать R?​

Шаг 1: Установка зависимостей​

Обновление системы​

Установка необходимых инструментов​

Шаг 2: Добавление репозитория CRAN​

Добавить GPG-ключ​

Добавить репозиторий для вашего дистрибутива​

Для Debian 11 (Bullseye)​

Для Debian 12 (Bookworm)​

Для Ubuntu 22.04 (Jammy)​

Для Ubuntu 24.04 (Noble)​

Обновить список пакетов​

Шаг 3: Установка R​

Проверить доступную версию​

Установить R​

Проверить установку​

Шаг 4: Использование R​

Запуск R в интерактивном режиме​

Интерфейс R​

Шаг 5: Установка пакетов из CRAN​

Установить пакет​

Пример: Установка популярных пакетов​

Загрузить пакет​

Практический пример с txtplot​

Шаг 6: Установка RStudio Server (опционально)​

Скачать и установить RStudio Server​

Проверить статус​

Настроить файрвол​

Доступ к RStudio Server​

Расширенная настройка​

Установить зеркало CRAN по умолчанию​

Установка системных пакетов для R​

Увеличение доступной памяти​

R-скрипты из командной строки​

Запуск R-скрипта​

Пример скрипта​

Популярные пакеты по областям​

Data Science​

Машинное обучение​

Статистика​

Устранение неполадок​

Ошибка при установке пакета​

Пакет не найден​

Недостаточно памяти​

Проверка установленных пакетов​

Обновление R​